武汉微生物学会成立于1952年11月9日，现有团体会员8个团体会员单位，个人会员1086人；学会现有9个专业委员会，以及学会办公室、科普工作委员会、学术工作委员会、开发工作委员会。

开展学术活动是学会的基本任务。六十多年来，搭建了国际学术交流精品平台、青年学术交流精品平台、全国性学术交流平台等一系列学术交流活动平台，共组织了学术交流活动400余次，参加人数26000余人次；吸引大批的海外学者回国服务，促使国内外科学家强强联合共建科研联合体，使学会的凝聚力、科技创新能力和国际影响得到大幅提升。

举办各种培训班90多次，参加人数达8000余人次；为政府提出科技工作者建议书10项；撰写科普文章40余篇；向各级政府反映科技工作者的心声，等等。

1987年以来，学会连续多年被科协授予先进学会称号。2015年通过了武汉市民政局组织的等级评估，评为4A。